تفاصيل الوثيقة

نوع الوثيقة : مقال في مجلة دورية 
عنوان الوثيقة :
High-throughput genotyping assay for the large-scale genetic characterization of Cryptosporidium parasites from human and bovine samples.
High-throughput genotyping assay for the large-scale genetic characterization of Cryptosporidium parasites from human and bovine samples.
 
لغة الوثيقة : الانجليزية 
المستخلص : The epidemiological study of human cryptosporidiosis requires the characterization of species and subtypes involved in human disease in large sample collections. Molecular genotyping is costly and time-consuming, making the implementation of low-cost, highly efficient technologies increasingly necessary. Here, we designed a protocol based on MALDI-TOF mass spectrometry for the high-throughput genotyping of a panel of 55 single nucleotide variants (SNVs) selected as markers for the identification of common gp60 subtypes of four Cryptosporidium species that infect humans. The method was applied to a panel of 608 human and 63 bovine isolates and the results were compared with control samples typed by Sanger sequencing. The method allowed the identification of species in 610 specimens (90·9%) and gp60 subtype in 605 (90·2%). It displayed excellent performance, with sensitivity and specificity values of 87·3 and 98·0%, respectively. Up to nine genotypes from four different Cryptosporidium species (C. hominis, C. parvum, C. meleagridis and C. felis) were detected in humans; the most common ones were C. hominis subtype Ib, and C. parvum IIa (61·3 and 28·3%, respectively). 96·5% of the bovine samples were typed as IIa. The method performs as well as the widely used Sanger sequencing and is more cost-effective and less time consuming. 
ردمد : 1469-8161 
اسم الدورية : Parasitology 
المجلد : 141 
العدد : 1 
سنة النشر : 1434 هـ
2013 م 
نوع المقالة : مقالة علمية 
تاريخ الاضافة على الموقع : Thursday, April 14, 2016 

الباحثون

اسم الباحث (عربي)اسم الباحث (انجليزي)نوع الباحثالمرتبة العلميةالبريد الالكتروني
JL Abal-FabeiroAbal-Fabeiro, JL باحث مشارك  
X MasideMaside, X باحث مشارك  
J LlovoLlovo, J باحث مشارك  
X BelloBello, X باحث مشارك  
M TorresTorres, M باحث مشارك  
M TreviñoTreviño, M باحث مشارك  
L MoldesMoldes, L باحث مشارك  
A MuñozMuñoz, A باحث مشارك  
A CarracedoCarracedo, A باحث مشارك  
C BartoloméBartolomé, C باحث رئيسي  

الملفات

اسم الملفالنوعالوصف
 38578.pdf pdf 

الرجوع إلى صفحة الأبحاث